pólo de biologia computacional e sistemas
promovendo excelência e inovação
O Pólo de Biologia Computacional e
Sistemas é um projeto proposto em 2009 pela Área de Pesquisa,
Desenvolvimento e Inovação em Genômica Funcional (área
10) do Instituto Oswaldo Cruz, Fiocruz
Missão
Pesquisa, desenvolvimento tecnológico e inovação em biologia computacional e sistemas, alinhadas com as prioridades do Ministério da Saúde e a Estratégia Nacional de Biotecnologia.
Eixos
1. Epidemiologia e taxonomia genômica:
(i) Determinar com alta acurácia/resolução a posição taxônomica de
patôgenos e seus vetores, (ii) identificar os melhores genes para a
caracterização molecular de alta resolução de patôgenos e seus vetores,
(iii) estudar sistematicamente (por pirosequenciamento) a prevalência e
incidência de microrganismos patogênicos para humanos na Amazônia,
(iv) estudar SNP e sua associação com doenças (medicina personalizada)
Núcleo : observatório avançado de
doenças emergentes.
2. Bioprospecção metagenômica:
Identificação e caracterização de novas moleculas com propriedades
farmacólogica e/ou potencial biotecnológico. Núcleo : moleculas
bioativas de interesse em saúde e biotecnologia.
3. Biodiversidade:
Estudo da biodiversidade de microrganismos em ambientes específicos
(tubo digestivo de vetores, diferentes partes do corpo humano, etc).
Núcleo: microbiomas para Sáude Pública
e Biotecnologia
4. Nanotecnologia e Biologia Sintética:
Metodologias para a rápida identificação de suceptibilidade e
resistência às drogas, como por exemplo “amperometria” e “relaxamento
magnético”. Melhoramento da efetividade de drogas:
desenvolvimento de novos sistemas de liberação de drogas no hospedeiro
baseado em nanotecnologia, como por exemplo o encapsulamento e
liberação de drogas anti-TB. O desenvolvimento e aplicação de
metodologias experimentais de manipulação genomica de
tripanossomatideos de importancia medica e economica como Trypanosoma
cruzi, Leishmania braziliensis e L. chagasi, T. vivax e T. evansi, além
de outros protozoários como Plasmodium falciparum e P. vivax, Giardia
sp., Toxoplasma gondii. Identificação e construção das denominadas
biopartes de tripanossomatídeos e demais protozoarios. Núcleo:
bancos de genomas ou suas partes construídos artificialmente
5. Desenvolvimento de sistemas de bancos de dados e software para
biologia computacional e sistemas:
Identificação in silico de novos alvos para drogas, diagnósticos e
genotipagem. Desenvolvimento de pipelines/workflows para análise de
dados de alta-vazão. Núcleo: Sistemas
de bancos de dados e software
últimas notícias
04/05/2010
Palestra sobre o sequenciador de terceira geração acontecerá na quinta-feira 27/05:
Harnessing Nature's Powerful Sequencing Engine: Single-Molecule Real-Time DNA Sequencing
Patrick A. Cooke, PhD (Pacific Biosciences):
http://systemsbiology.biowebdb.org/?p=290
29/04/2010
Primeira defesa do
programa de pós-graduação em Biologia Computacional e Sistemas
aconteceu na quarta-feira de 28 de bairl de 2010:
http://www.fiocruz.br/ioc/cgi/cgilua.exe/sys/start.htm?infoid=820&sid=32
20/04/2010
Palelestra sobre
CDTS reforça a forte interação esperada entre o CDTS e IOC. Isto
também inclui interações entre o Pólo de Biologia Computacional e
Sistemas e
o CDTS :
http://www.fiocruz.br/ioc/cgi/cgilua.exe/sys/start.htm?infoid=811&sid=32
19/04/2010
Curso de inverno de
"Biologia Computacional e Sistemas" será oferecido em julho no IOC,
Fiocruz. Público alvo: alunos de graduação.
19/04/2010
As inscrições para o
Brazilian Symposium on Bioinformatics e International Workshop on
Genomics Databases, eventos co-localizados em Búzios (RJ) estão
abertas.
links
Progama de Pós-graduação em Biologia Computacional e Sistemas:
http://www.fiocruz.br/iocensino/cgi/cgilua.exe/sys/start.htm?sid=69
Plataforma Bioinformática do IOC:
http://platform.biowebdb.org
Plataforma Bioinformática do PDTIS:
http://157.86.44.10/~otto/pdtis/
Instituto Oswaldo Cruz:
http://www.ioc.fiocruz.br
Consórcio BiowebDB:
http://www.biowebdb.org
BSB 2010:
IWGD 2010:
http://www.biowebdb.org/iwgd/2010/